"Моя геройская академия" следует за историей Идзуку Мидории, юноши, который осознал, что мир, в котором он живёт, наполнен людьми с невероятными способностями, называемыми квирками. В отличие от большинства, Идзуку не обладает квирком, но его желание стать героем, защищающим других, не затмевается этими обстоятельствами.

Под влиянием своего кумира, героя Всемогущего, Идзуку поступает в академию героев, Юэй, где начинается его путь к самопознанию и превращение из неудачника в настоящего героя. В этом новом окружении Идзуку сталкивается с трудностями, завистью, но также находит верных друзей и наставников, помогающих ему развивать свои навыки и становиться сильнее.

Путём борьбы, самопостижения и встреч с множеством уникальных персонажей, Идзуку покажет, что даже без квирка можно обрести героизм и стать легендой в мире, полном опасностей и вызовов.