«Младшая сестра моего друга досаждает» — это комедийное аниме, которое разворачивается вокруг главного героя, всячески избегающего серьезных отношений и общения с девушками. Он ценит свою свободу и не стремится заводить романтические связи, предпочитая проводить время в одиночестве или с единственным верным другом. Однако его спокойной жизни приходит конец с появлением надоедливой младшей сестры этого друга — Ирохи.

Эта девушка, с внешностью милой школьницы, обладающая роскошными волосами, большими блестящими глазами и притягательной фигурой, проявляет невероятную настойчивость в попытках завоевать внимание главного героя. Она бесцеремонно врывается в его личное пространство, демонстрируя свое желание и делая двусмысленные намеки. Ироха не упускает ни одного шанса вывести его из себя, намекая, что он — парень её мечты, и она не может думать ни о ком другом.

Несмотря на свою популярность в школе, где многие юноши мечтают о такой страстной и безупречной красавице, как Ироха, главный герой испытывает к ней лишь раздражение. Однако, как бы он ни старался отбиваться от её внимания, он не может отрицать, что сам часто думает о ней: о её волосах, глазах, теле и заразительном смехе, который сводит его с ума. Это создает комичную и порой неловкую ситуацию, где взаимное притяжение смешивается с попытками героя сохранить свою независимость.