В повествовании "Моя геройская академия 5" молодой герой, Идзуку Мидория, продолжает свой путь обучения в академии "Юэй" с желанием стать величайшим героем. После первого года обучения, где он становится сильнее и увереннее, назревают непонятные проявления связанные с его квирком "Один за всех", которые даже Всемогущий, предшественник этой силы, не может объяснить.

Идзуку оказывается перед необычной задачей разобраться в себе и своей способности, чтобы преодолеть новые препятствия и стать еще мощнее. В это время враги не спят, и лидер "Альянса злодеев" Томура Сигараки задумывает новый ужасный план, который требует немедленного противодействия.

Будущему герою предстоит не только постигнуть себя и раскрыть тайны своего квирка, но также быть готовым сражаться в любой момент и защищать своих близких и свой идеал геройства. В этом нелегком пути его поддержат верные друзья, готовые стоять плечом к плечу в борьбе за справедливость и мир.